本校設立於日本大正13年(西元1924年),民國13年4月1日,原名新竹州立新竹高等女學校,初以校舍未建,借新竹小學 (今東門國小)校址開辦,設4年制本科及1年制專修科,至民國15年4月現址校舍落成,始行遷入。
民國34年台灣光復,是年11月行政長官公署教育處遴派姜瑞鵬先生接收視事,12月1日正式開學上課,因而訂是日為光復後本校校慶之期。12月5日奉令改稱校名為「台灣省立新竹女子中學」,分設初、高中部,學生人數亦日漸增加。
唯自民國45年秋,奉教育部令指定新竹為免試升學實驗區後,初中部即逐年結束,至47年秋,本校乃改為完全高級中學。溯自日治時代至台灣光復,日治時期高中部已辦理19屆(民國35年開始召收光復後第一屆高中生),初中部則自光復後至民國47年秋共辦13屆。民國48年7月,省派孟淑範女士接掌校務;光復以來兩任校長精心擘劃,建樹良多。60年4月孟校長調任台南女中,同年4月,省派沈雅利女士接掌校務,由於學生班級已增至51班,教室及實驗室均不敷用,自61學年度起,逐年增建教室,並充實教學設備,興建「中正育樂中心」(民國71年落成啟用)及學生宿舍,升學率年有增進,校譽日隆。
民國74年2月,沈校長退休。同年2月5日,省派王雁彬女士接掌校務。76年8月王校長調任台南家齊女中,省派鍾香華女士接掌本校校務,並自77學年度起增設美術實驗班,男女兼收,創女校招收男生先例,並於83學年度增設數理資優班,逐年改設完成培育數理資優科學人才,同年藝能大樓落成。
民國86年8月鍾校長調任桃園楊梅高中,省派陳健鏘先生接掌本校校務,積極籌建科學大樓(舊藝能科教室改建),美化校園環境,改善充實教學設備,發展校園網路資訊教育,推展終身學習理念,運用社會資源,發展學校成為社區文化中心的堡壘。民國91年奉教育部指示本校擔任國民中學學生基本學力測驗全國試務委員會主辦學校,圓滿完成任務。92年8月陳校長榮調南投中興高中,校務由教務處張瑞欽主任代理至93年1月。
民國93年2月教育部遴選原新竹高中周朝松校長至本校接掌校務,周校長到任後,積極推動學生品格教育,重視校園倫理傳承文化,鼓勵老師研究進修,發展各科特色,關懷生命教育,建立深廣的閱讀文化。民國100年本校成為全國唯一擔任過兩次國民中學學生基本學力測驗全國試務委員會之主辦學校,於首度實施冷氣試場開放及與北北基聯測攜手完成基測試務等重大議題,深獲肯定。另為建立學校更優質的教學環境,經多方努力 ,於民國100年獲教育部核定拆除第二,三,五棟教學大樓,於第五棟教室舊址改建為地下一層地上六層之綜合教學大樓,為學校校園發展奠下美好的遠景。民國102年2月周朝松校長屆齡退休,校務由學務處吳原榮主任代理至102年7月。
民國102年8月,國立桃園啟智學校呂淑美校長獲教育部遴選至本校接掌校務,呂校長到任後積極營造溫馨和諧友善的校園氛圍,以「全人發展、博雅溫馨、優質學習、適性揚才、精緻卓越」為本校102-106學年度校務發展計畫之教育目標。原拆除的二、三棟舊址於104年綠化美化為「第八日」外牆裝置藝術及同心圓大草坪。106年帶領本校同仁規劃「包容力」、「創造力」、「思辨力」、「實踐力」為本校未來學生圖像,並以「數位校園」、「多元展能」與「接軌世界」為本校107-111學年度校務發展計畫主軸,以期實踐「建構多元適性的學習環境,培養自信竹女人」之學校願景,校務蒸蒸日上,升學屢創佳績。
民國110年8月呂淑美校長調任國立竹南高中,國立竹東高中林桂鳳校長經教育部遴選接任本校校長,再展新猷,以全人成長、有效學習、和諧關係、永續發展為治校理念,以期達成精緻教學、多元展能、深化境教、關懷友善之教育目標。林校長為繼鍾香華校長以來第二位回母校擔任校長的校友,民國113年適逢創校百週年校慶,林校長將校史室、育樂中心、操場及籃球場等場館美化整修,為追尋創校校長塚本清吉的足跡到日本展開竹女的尋根之旅,並積極進行國際教育交流的校務推動與姐妹校的締結活動。